《唯識藏》內容包括印度大乘佛教中期「瑜伽行派」及中國唐朝「唯識宗」創宗立派之所有典籍，擇其中之要者，全文收錄，餘則以存目寫提要方式，暫收於附錄中。所收典籍，含括佛說之經，彌勒、無著、世親、護法、安慧等十大論師所造之論，及玄奘大師與其門下弟子，如窺基、慧沼等，乃至宋元明清等祖師之注疏論著。

　　唯識學號稱「佛教心理學」，對於眾生心意識之分析極為獨到而權威。然因為名相繁瑣，相關典籍又存在勘刻錯誤、錯簡、錯字等種種問題，缺乏整理而乏人問津。《唯識藏》歷經八年整編，將所有唯識相關典籍中，決定其思想發展之最重要一批典籍，選擇歷代藏經中最好的刻本作為底本，將其中所有古字重新整理成現代人易讀易懂的字，其中所有誤刻、漏刻等，也根據其他可靠資料重新還原其本來面目，透過現代標點分段處理，使唯識典籍更加容易閱讀，透過閱讀，能更清楚掌握唯識法門之完整樣貌，並透過其中之細膩分析，幫助自己，轉識成智。

　　除了古代祖師們留下來的精彩智慧與修行心得，《唯識藏》中還精選民國以後的優秀作品，如慈航法師、印順法師等，及星雲大師主要關於心識的講說內容，提供讀者入門研習。

《唯識藏》冊目

第一箱

1.菩薩地持經 ∕ 菩薩善戒經
2.楞伽阿跋多羅寶經 ∕ 入楞伽經 ∕ 大乘入楞伽經
3.深密解脫經 ∕ 解深密經 ∕ 大乘密嚴經(日照譯) ∕ 大乘密嚴經(不空譯)
4.瑜伽師地論一(1~19卷)
5.瑜伽師地論二(20~40卷)
6.瑜伽師地論三(41~60卷)
7.瑜伽師地論四(61~81卷)
8.瑜伽師地論五(82~100卷)
9.攝大乘論(佛陀扇多譯) ∕ 攝大乘論(真諦譯) ∕ 攝大乘論本 ∕ 大乘莊嚴經論
10.大乘阿毗達磨集論 ∕ 大乘阿毗達磨雜集論
11.顯揚聖教論 ∕ 三無性論 ∕ 三自性論
12.唯識論 ∕ 大乘唯識論 ∕ 唯識二十論 ∕ 中邊分別論 ∕ 辯中邊論 ∕ 大乘五蘊論 ∕ 大乘廣五薀論 ∕ 大乘百法明門論 ∕ 業成就論 ∕ 大乘成業論 ∕ 六門教授習定論 ∕ 顯識論 ∕ 轉識論 ∕ 唯識三十論頌 ∕ 佛地經論
13.成唯識寶生論 ∕ 成唯識論 ∕ 能顯中邊慧日論
14.解深密經疏一(1~19卷)
15.解深密經疏二(20~40卷)
16.入楞伽心玄義 ∕ 楞伽阿跋多羅寶經通義
17.注大乘入楞伽經
18.攝大乘論釋(世親造‧真諦譯)
19.攝大乘論釋(世親造‧玄奘譯) ∕ 攝大乘論釋(無性造‧玄奘譯) ∕ 瑜伽師地論釋
20.瑜伽師地論略纂一(1~8卷)

第二箱

21.瑜伽師地論略纂二(9~16卷)
22.瑜伽師地論記一(1~18卷)
23.瑜伽師地論記二(19~41卷)
24.瑜伽師地論記三(42~60卷)
25.瑜伽師地論記四(61~80卷)
26.瑜伽師地論記五(81~100卷)
27.大乘阿毗達摩雜集論述記一(1~15卷)
28.大乘阿毗達摩雜集論述記二(16~30卷)
29.成唯識論述記一(1~3上卷)
30.成唯識論述記二(3下~5上卷)
31.成唯識論述記三(5下~7下卷)
32.成唯識論述記四(8上~10下卷)
33.唯識二十論述記 ∕ 辯中邊論述記 ∕ 大乘百法明門論疏 ∕ 唯識三十論約意 ∕ 八識規矩直解 ∕ 唯識三十頌講錄
34.大乘法苑義林章
35.唯識學探源 ∕ 相宗十講
36.八識講話 ∕ 談心的秘密 ∕ 佛教對心識的看法 ∕ 夢的神奇 ∕ 從心的動態到心的靜態 ∕ 唯識要義
37.方便心論 ∕ 如實論 ∕ 觀總相論頌 ∕ 觀所緣緣論 ∕ 無相思塵論 ∕ 解捲論 ∕ 掌中論 ∕ 因明正理門論本 ∕ 因明入正理論 ∕ 取因假設論 ∕ 觀所緣論釋 ∕ 集量論略解
38.因明入正理論疏 ∕ 陳那以前中觀派與瑜伽派之因明
39.未入藏典籍提要
40.總索引